更重要的是，深中通道的开通有利于进一步促进人流、物流、资金流、技术流等生产要素在大湾区城市群的高效流动与有效配置，促进大湾区形成优势互补、错位发展的产业链供应链体系，助力大湾区打造国际一流湾区和世界级城市群。
深中通道的开通，将原来的车程时间从2小时缩至30分钟，进一步缩小了深圳与中山、江门、珠海等珠江西岸城市的时空距离，为产业的合作与协同提高了良好的基础底盘。随着生产要素的快速流动和有效配置，两地也将进一步优化产业格局。一方面，深圳是大湾区核心引擎城市，具有“双区”驱动、“双区”叠加的优势，已经形成文化、高新技术、物流和金融等支柱产业，并壮大“20＋8”产业集群。另一方面，珠江西岸汇集了新一代电子信息、高端装备制造、生物医药与健康、智能家电等产业集群，科学技术应用范围广，工业基础扎实。未来，深圳可与珠江西岸形成“研发-生产-市场”的完整链条，共同参与全球竞争。
目前，深圳拥有空港型、港口型、商贸服务型和生产服务型四类国家物流枢纽。深圳港是全球第四大、中国第三大集装箱港口，深圳机场货物吞吐量排名全国第三，是我国乃至世界上重要的物流枢纽。深中通道的开通，将进一步发挥深圳港口和机场的集聚效应，通过快速联通中山、珠海、江门、南沙等区域，不断扩大货运规模。
同时，机场和港口的枢纽作用也将进一步发挥，其经济辐射效应也会不断扩张，从而带动中山、江门、南沙等更多区域的快速发展。以深圳宝安国际机场为例，通过在中山、江门等地建设机场的前置货站，一方面可以将机场的临空经济的效益外溢至中山和江门等地，为制造业企业提供更加便捷高效的物流服务，另一方面也将不断提升机场的货物吞吐量，助力深圳打造世界级的空港。
深圳是跨境电商的重要枢纽。据统计，2023年深圳跨境电商进出口额达3265.3亿元人民币，同比增长74.4%。深圳市海陆空铁各类货运口岸已达16个，开展跨境电商业务的海关监管场所和保税区域已达11个，深圳机场国内外货运航线通航点达到60个，深圳港已开通20多条跨境电商海上快线。
深中通道的开通，使得珠江西岸的企业可以依托深圳开展跨境电商业务，拓展国际市场。一方面，有助于珠江西岸地区做大跨境电商业务规模，提升本地企业产品的国际化水平。另一方面，有助于不断扩大深圳跨境电商在全球的影响力，更好地放大跨境电商贸易规模，使得大湾区更好地参与全球的市场和分工。